（一）办公室

　　（二）发展规划处

　　（三）综合处

　　（四）经济体制综合改革处（市经济体制改革办公室）

　　（五）投融资处

　　（六）农村经济与城镇化处

　　（七）区域合作处

　　（八）产业协调处

　　（九）创新与高技术发展处

　　（十）服务业发展处

　　（十一）交通发展处

　　（十二）生态处

　　（十三）社会发展处

　　（十四）价格管理处

　　（十五）收费管理处

　　（十六）法规处（审批处）

　　（十七）项目前期工作处

　　（十八）重点建设项目管理处

　　（十九）军民融合发展推进处

　　（二十）评估督导处（经济与国防发展处）

　　（二十一）项目联络处（市人民政府驻北京办事处项目处）

　　（二十二）对外经济处

（二十三）社会信用推进处

（二十四）营商环境建设处

　　（二十五）粮食储备和流通发展处

　　（二十六）粮食监督检查处（粮食基金管理处）

　　（二十七）能源发展处（市电力执法办公室）

（二十八）组织人事处

　　　　　机关党委

　　　　　离退休干部处

直属行政机构

　　（一）厦门市发展和改革委员会价格监测和成本监审局

　　（二）厦门市发展和改革委员会粮食监管一局

　　（三）厦门市发展和改革委员会粮食监管二局